秘鲁丛林是游戏早期接触的首个大型探索区域，这里雨林密布遗迹散落，充满了需要动脑的解谜环节和突如其来的战斗场景，整个区域的核心围绕着探索墓穴和水流机关展开，你需要频繁使用劳拉的生存本能技能来高亮显示可互动的物体和收集品。
区域内的解谜往往与环境紧密相连，例如在水塘边你将首次学习使用弓箭隔断绳索来取得空中的物资，深入丛林遇到的第一个重要谜题通常涉及古老的水利机关，典型情况是遇到被路障阻挡的去路旁边有带绳索线圈的杠杆，这时需要切换到弓箭瞄准并射击那个绳索圈来拉动杠杆，让水流或泥沙堆积在路障前的容器里从而清出道路，这种利用环境物理机制的解谜方式在秘鲁丛林中很常见。在探索过程中找到地图或探险家背包能解锁区域地图标记，帮你清晰定位求生贮藏点文献遗物等收集品的位置。
除了主线路径秘鲁丛林还隐藏着被称为墓穴的古墓挑战比如审判凝视和冥界之门，探索这些古墓通常需要更复杂的解谜技巧，在一个古墓里你会遇到需要推动的石轮机关将其推到顶点后会触发限时机制，你必须迅速从右侧跳到下层平台并用绳索箭矢连接降下来的绳桩与对岸断桥上的绳桩来搭建通路，顺利解开古墓谜题能获得丰厚的技能点数奖励。留意散落在遗迹角落的雕花木盒和红色木盒，打开它们可以提升你的语言知识等级或获得文物，而提升克丘亚语等知识等级是破译独石碑的先决条件。
应对丛林中的敌对威胁需要讲究策略，你会遭遇野兽和敌对武装人员正面强攻并非上策，应优先利用丛林中的草丛和树木进行隐蔽悄悄接近敌人实施潜行攻击以节省资源并降低风险，如果进入交火状态则要善于利用周围的岩石残骸等作为掩体进行躲避和射击，并注意保持移动避免被敌人包围，游戏在此强调了与丛林合而为一的理念鼓励玩家将环境本身转化为战术优势。
