武器系统的选择直接影响通关效率与生存能力。综合系列作品的核心设定，量子加农炮与常规加农炮被广泛认定为后期最强火力代表。量子加农炮具备全屏范围杀伤能力，蓄力后可瞬间清除密集敌群，尤其适用于最终Boss战的高压场景；常规加农炮则凭借高单发伤害与稳定范围输出，成为对抗重型异形的核心装备。这两类武器均需在游戏后期关卡中通过高风险操作获取，例如摧毁特定反应堆或突破敌群封锁。
量子加农炮的战术价值体现在其不可替代的清场能力。该武器蓄力释放的能量冲击可覆盖整个屏幕，对范围内所有敌人造成毁灭性打击，有效缓解被包围的危机。但每次使用后需经历120秒冷却期，故需严格把控使用时机。常规加农炮虽无全屏攻击特性，但其持续输出的可靠性与弹药效率更优，尤其擅长应对机甲护身的异形单位。玩家需权衡两者的战术互补性：量子加农炮用于关键清场，加农炮负责常规推进。
除终极武器外，霰弹枪系在中前期占据重要地位。其近距离爆发力可瞬秒普通异形，且散射特性对自爆虫等小型单位有显著压制效果。部分高阶霰弹枪通过双持操作可实现火力无缝衔接，弥补射速缺陷。但面对后期高护甲目标时，霰弹枪的杀伤效率明显落后于能量武器。副武器系统中，COP系列因近战两三枪毙敌的特性成为突围利器，尤其在狭窄空间遭遇高速敌人时价值凸显。
开放场景中优先配置量子加农炮与火箭筒进行范围压制；狭窄通道则依赖霰弹枪与火焰喷射器构建火力网。能量武器虽对重型单位效果显著，但弹药消耗量极大，需配合智能芯片提升携带上限。终极武器的获取往往伴随苛刻条件，例如最终关卡需在倒计时内摧毁四根能量导管，此举要求玩家精确规划路线并预判敌群行为。
孤胆枪手系列的最强武器需满足三项核心指标：范围杀伤效率、对精英单位的压制力、战术适应性。量子加农炮与常规加农炮因同时兼具这些特性成为公认首选。但玩家不应忽视武器系统的阶段性差异——霰弹枪与冷冻枪等过渡装备在特定关卡仍具不可替代性。合理分配资源升级主副武器，结合环境切换战术策略，方为突破异形潮的核心要义。
