秘术是决斗场中至关重要的战斗辅助手段，合理搭配秘术能显著提升忍者的实战表现。秘术系统主要分为攻击型、防御型和辅助型三大类，攻击型秘术如水遁·水冲波可造成范围伤害并增强连击能力，防御型秘术如禁术·阴愈伤灭能提供霸体状态应对控制，辅助型秘卷如气旋则用于干扰对手走位。选择秘术需结合忍者特性，爆发型忍者适合搭配查克拉秘术刷新技能，而消耗型忍者更适合冻雪等限制类秘术。
秘术的获取与强化需要通过游戏内特定途径完成。玩家可通过分解冗余饰品获得秘术之尘作为强化材料，也可通过参与秘境副本、组织商店兑换或限时活动直接获取秘术碎片。部分高阶秘术如忍体术·反具有伤害反弹特性，需通过特殊活动解锁。秘术等级提升会增强效果参数，但需平衡资源分配，避免过度集中培养单一秘术导致战术单一化。
实战中秘术的释放时机直接影响战局走向。防御型秘术应在预判对手控制技能前开启，如通灵·手里剑护身需在近战忍者突进时使用。攻击型秘术则需配合忍者技能形成连招，风遁·压害的吸附效果可衔接范围奥义实现爆发输出。掌仙术·活等恢复类秘术存在治疗间隔，需在安全位置提前施放。秘术冷却时间普遍较长，需避免无谓消耗。
高阶玩家需掌握秘术的战术联动机制。冰遁·冻雪与幻术·此处非之术的组合可延长控制链，火遁·鼠毛玉的追踪特性可压制替身术使用。面对霸体状态敌人时，忍体术·怒是关键的破解手段。部分秘术存在隐藏机制，如雷遁·雷电击命中后能短暂暴露对手位置。建议通过训练场测试不同秘术的判定范围和持续时间，建立个性化的战术数据库。
秘术系统的深度体现在与忍者技能的化学反应当中。奈良一族角色搭配影子模仿术后使用扦插之术可实现长时间控制，而春野樱等体术忍者配合霸体秘术能突破远程火力封锁。需注意秘术效果会受场景地形影响，水遁系秘术在狭窄通道中范围更大。
