载机舰作为舰队中搭载战机的核心单位，其使用方式直接影响空战效率。首先需要明确载机舰的类型区分，主要包括航母类（如CV3000、太阳鲸）和巡洋/驱逐载机型（如苔原、谷神星载机）。航母通常可搭载6-10架战机或护航艇，而巡洋/驱逐载机型仅能搭载2-4架中型战机。搭载前需通过蓝图研究解锁对应战机生产线，并在机库界面选择已生产的战机进行装配。战机分为对空、对舰、侦察等类型，需根据舰队需求搭配，例如制空优先选择小米、T800，对舰输出则侧重维塔斯B或刺鳐。
载机舰的战术定位决定战机配置逻辑。若作为主力舰队核心，建议采用混合配置：航母可搭配4架对空战机（如小米+孢子）和4架对舰战机（如维塔斯B+牛蛙），兼顾制空与火力；巡洋载机型因容量有限，建议专精单一功能，例如苔原载机全配林鸮用于防空。注意战机返回机制，所有战机在持续攻击20-30秒后会返回母舰维修，载机舰的载机维护系统能缩短10%维修时间，技术值应优先强化该模块。部分载机舰如谷神星载机自带维修无人机，可为返回战机提供血量恢复。
载机系统的强化顺序建议为：先点满载机攻击力提升和载机命中率，再补足载机冷却缩减或锁定时间缩短。对于航母，太阳鲸需额外强化护甲与拦截系统，CV3000则侧重机动性提升。护航艇搭载需单独考虑，T800因兼具防空与对舰能力成为首选，但会占用护航艇舱位，若需纯对舰输出可替换为蜂巢或星脉。
航母应部署在战场后方300-400单位距离，利用曲率跳跃坐标保持机动性；巡洋载机型则需跟随主力舰队，为中排提供防空支援。编队时注意载机舰与护航舰的比例，例如每艘航母建议配备2-3艘防空型巡洋舰（如光锥级）拦截敌方战机。若遭遇敌方航母编队，可通过包夹战术让高速输出舰队绕后，优先摧毁其载机舰。舰载机生产线需消耗大量金属与晶体，建议连接高等级矿点并建设前哨站保障供给。战机损失后需重新生产，因此需保留至少30%资源作为应急储备。
